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討論串[問題] 關於NCBI的BLASTn之後的data
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#3
Re: [問題] 關於NCBI的BLASTn之後的data
推噓2(2推 0噓 1→)留言3則，0人參與, 最新作者huggie (huggie)時間19年前 (2007/06/03 14:37), 編輯資訊
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Score (bit score):. BLAST 對 alignment 的好壞的計分評量。align的片段越長分數越高，. 但如果 alignment 遇到 gap 就會扣分，開 gap 扣分比延長 gap. 扣分來得高。最後加加減減總結的結果就會有個分數出來。 Score. 越大表示 matc
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#2
Re: [問題] 關於NCBI的BLASTn之後的data
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者mckendri.時間19年前 (2007/05/30 02:01), 編輯資訊
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你要不要把blast的結果post上來 大家討論一下. 這樣比較好溝通. ==> YuDavid.bbs@ptt.cc (討厭失眠) 提到:. > 各位高手大家好. > 我在做"細菌菌種鑑定"的實驗. > 主要步驟是提取total DNA 然後PCR夾出16S rRNA gene然後去BLAST 鑑
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#1
[問題] 關於NCBI的BLASTn之後的data
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者YuDavid (討厭失眠)時間19年前 (2007/05/28 01:14), 編輯資訊
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各位高手大家好. 我在做"細菌菌種鑑定"的實驗. 主要步驟是提取total DNA 然後PCR夾出16S rRNA gene然後去BLAST 鑑定到"屬"或"種". 我將定序出來的結果到BLASTn去輸入. 出來了一些資料包括max score, total score, query coverag
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