討論串[問題] 請問microarray的資料分析
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推噓0(0推 0噓 0→)留言0則,0人參與, 最新作者sirius1980 (真無聊)時間19年前 (2006/03/08 20:44), 編輯資訊
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想請問一下各位前輩. 當microarray的資料回來之後,都是如何分類它的. 因為實驗室不是特別在做生物資訊的,那老師目前要我們自己去手動分類. 不知道有做過相關實驗的前輩是否可以提供一些意見. --. 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc). ◆ From: 140.109.40.22.

推噓3(3推 0噓 0→)留言3則,0人參與, 最新作者HAYATO (我不是梁朝偉)時間19年前 (2006/03/09 00:42), 編輯資訊
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看你們家有興趣的是哪方面的基因. 就看那些就可以了. 其他略過不管,因為你們可能也無法解釋那些DATA. 分類的話,舉例來說. 如果是做細胞凋亡的,把細胞凋亡的相關的Protein或是gene. 對應到的microarray data用EXCEL放在一起. 或是細胞骨架蛋白相關的放一起. 細胞傳遞的
(還有4個字)

推噓0(0推 0噓 0→)留言0則,0人參與, 最新作者sunchen (小太陽)時間19年前 (2006/03/10 14:43), 編輯資訊
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隨機不是都有一些軟體?. 再操作microarray的時候,可以跟負責的實驗室詢問一下呀.... 相關軟體應該也很多..... 你當初去作microarray的動機是什麼?. 你的sample是什麼?. 用這個方式去搜尋,就會找到一堆了.... --. 實驗室裡的心情起伏都在這喔. http://w

推噓0(0推 0噓 0→)留言0則,0人參與, 最新作者LinusChen (小強一號原型機)時間19年前 (2006/03/10 17:20), 編輯資訊
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這方面的軟體很多 但是要怎麼分類還是要看實驗設計決定. 要錢的軟體在台灣比較有名的就是 GeneSpring. 可以去下載試用版...30天試用................(有破解秘法). 優點是有漂亮的 user interface. 缺點是超級吃系統資源的 loading 很重. 不用錢的有
(還有22個字)

推噓0(0推 0噓 0→)留言0則,0人參與, 最新作者catherinejoy (whatcanisay)時間19年前 (2006/03/11 07:11), 編輯資訊
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不是很確定你的實驗設計 還有你所說的分類是不是clustering. 我們實驗室的同伴 目前正在寫程式分析酵母菌的葡萄糖代謝功能. 有興趣合作的話 可以跟我連絡囉. --. 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc). ◆ From: 128.135.150.18.
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