[求救] paper問題 拜託幫忙

看板Biotech (生命科學)作者 (小燕子)時間1周前 (2024/05/06 14:47), 1周前編輯推噓0(0012)
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各位先進好,有一些paper問題想請教 Paper標題:Tissue-resident memory CAR T cells with stem-like characteristics d isplay enhanced efficacy against solid and liquid tumors 連結:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10313923/ 主要是圖看不太懂,很多圖都是第一次看到,雖然上網查了很多資料,但還是對於paper 圖的意義不理解 像Fig.1 的圖A https://i.imgur.com/yXsTY0p.jpeg
Flow的等高線圖越密集應該是代表表現量越高吧,CAR-TRM右上(+,+)和左下(-,-)表現差 不多,這是代表什麼意思? Fig.6的圖I https://i.imgur.com/MXm8Yuq.jpeg
這種圖要怎麼看,CAR-TRM在有無CD103的情況下的表現,框框代表什麼,在框框內外是什 麼意思?沒有查到y軸的SSH-H是什麼? Fig.2的圖A https://i.imgur.com/lzqAQIa.jpeg
第一次看到PCA圖,查的資料都是這是將資料降維,有三種主成份,但還是不懂點的遠近 跟位置代表什麼意思 Fig.3的圖A和Fig.S4的圖B https://i.imgur.com/Qa7z1Wr.jpeg
https://i.imgur.com/OxRiPcG.jpeg
也是第一次看到UMAP圖,查到是相似的會聚集在一起?Fig.3這是收集細胞後擴增,利用s cRNA-seq處理,再進行聚類分析,第一張是可以看出三種標記的表現量比較,點的數量就 代表表現量嗎?第二張圖的紅點較多代表什麼意思,CAR-TRM的擴增較多?第三張完全看 不懂,這是代表細胞主要在哪個階段嗎?是CAR-Tconv還是CAR-TRM,這樣也看不出量多寡 ,點的位置有意義嗎? Fig.S4點的數量是表現量嗎?這樣是MKI67表現較多?還是要對照點分佈的位置一起看? 拜託各位先進幫忙,可能很多笨問題,但真的研究很久還是不懂,謝謝您們! 如果內容太多,留言不太方便,可以站內信,謝謝! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 223.137.140.21 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1714978024.A.5F8.html

05/06 15:22, 1周前 , 1F
個人覺得,如果沒有flow cytometry和scRNAseq的概念,
05/06 15:22, 1F

05/06 15:22, 1周前 , 2F
實在很難用文字描述到讓你明白…
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05/06 21:04, 1周前 , 3F
大學?碩士?學科背景?有多少相關技術知識?
05/06 21:04, 3F

05/06 21:05, 1周前 , 4F
這些圖都算簡單的了,就算是第一次看也該能理解才對,
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05/06 21:05, 1周前 , 5F
現在 Cell 和 Nature 上盡是些奇葩分析的奇葩圖表,那
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05/06 21:06, 1周前 , 6F
些真的有夠難理解的。
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05/06 21:06, 1周前 , 7F
然後常常在版上看到這類詢問知識還想請人手把手教的文
05/06 21:06, 7F

05/06 21:07, 1周前 , 8F
,對於專業知識被如此廉價的看待感到很無奈
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05/06 21:43, 1周前 , 9F
要給建議的話,我會說:你會看不懂是因為你的理解幾乎
05/06 21:43, 9F

05/06 21:43, 1周前 , 10F
都錯了,請搭配文章內文的描述,去推測這張圖要怎麼解
05/06 21:43, 10F

05/06 21:44, 1周前 , 11F
讀會符合文章想表達的意思
05/06 21:44, 11F

05/07 13:00, 1周前 , 12F
已解惑,謝謝
05/07 13:00, 12F
※ 編輯: abeautiii (223.137.140.21 臺灣), 05/07/2024 13:00:55
文章代碼(AID): #1cE7peNu (Biotech)
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