[問題]預測設計的ligand是否會和receptor結合

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者 (能唸完研究所嗎?哭哭)時間15年前 (2009/12/30 18:00), 編輯推噓2(202)
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各位學長姐好 我目前遇到的問題是 我希望設計出一段約10 amino acid的ligand 去和receptor結合後抑制他和正常ligand的結合 因此我上網去找預測docking的軟體去預測分析 我嘗試用autodock軟體 可是用了好久都不懂要如何操作autodock軟體 所以想請問各位學長姐 是否有其他預測軟體或線上分析網站可以使用 希望能好操作一點 來預測ligand和receptor間的docking p.s.小碩一生剛踏入生資領域 如果問了笨問題請大家多多指教 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.117.39.167

12/30 19:31, , 1F
AUTODOCK好像只能用在PROTEIN跟小分子的結合
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十個AA分子量應該破千了吧,而且也不夠RIGID,看看有沒有專
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門做這類DOCKING的軟體吧
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Dock,GOLD,Flex,AMBER,CHARMM?
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文章代碼(AID): #1BEoJKVn (BioMedInfo)
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