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[問題]rnaseq分析 基因表現量算法

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者 (violence阿公)時間2年前 (2022/04/01 00:57), 編輯推噓1(1推 0噓 1→)
留言2則, 1人參與, 2年前最新討論串1/1
如題 大家好 朋友在做rnaseq後 在分析完基因表現量再去找有顯差基因的時候 給別人試跑後 跑出來的data的表現量有0 0應該是沒有reads吧 但是fold change卻可以算出來 想很久看不出來0還會有fold change 想請教大大 並附上excel圖 https://i.imgur.com/DmMsbAh.jpg
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推
04/05 18:39, 2年前 , 1F
這看起來是DESeq2的結果，DESeq2用的是Read counts做
04/05 18:39, 1F
→
04/05 18:39, 2年前 , 2F
計算，不是用FPKM。先跟朋友確認一下他的Input是什麼
04/05 18:39, 2F
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