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[討論] Next Generation Sequencing and Microarray

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者 (左慈)時間15年前 (2010/01/09 08:21), 編輯推噓5(5推 0噓 6→)
留言11則, 5人參與, 最新討論串1/1
最近在看NGS (next generation sequencing) 的一些網站， 其中一個中文網站認為 NGS可以取代Microarray， 這就是我不懂之處， Microaray 是幫助我們了解 gene expression 在不同樣本間比較 (比如有病 VS 健康) NGS是分析genomic at sequence-base 兩種方法對我而言目的不同， 如何討論"取代" -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 115.64.9.214
推
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People can use NGS to sequence cDNA or mRNA.
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By mapping the sequence reads to reference genome,
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we can directly count the number of reads from
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each gene. I personally prefer this over micro-
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array, which only compares the fluorescence,
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leaving rooms for error. (Although I haven't done
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either of them yet.)
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推
01/10 00:23, , 8F
如樓上 可以去查一些 RNA-seq 的 review paper 看看
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推
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去思考一下NGS如何產生data 以及它的量和品質就可以知道
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推
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Nat Rev Microbiol. 2009 Apr;7(4):287-96. 參考一下
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推
01/28 00:28, , 11F
是可以取代，但是NGS價格實在太貴了...
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