[工具] OMIM之同一欄位內多個Gene/Locus代表意義

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者 (拉回即是埋點)時間13年前 (2011/07/19 19:23), 編輯推噓0(004)
留言4則, 3人參與, 最新討論串1/1
想請問板上的大家, 最近小弟在查詢OMIM基因的時候有些問題不太懂。 就是譬如今天利用Gene Map查詢精神分裂症(Schizophrenia), 我們大概會得到某筆資料: http://ppt.cc/_xPU Location | Gene/Locus | ...略...| Gene/Locus MIM number | | | 1:203,148,058| CHI3L1, GP39, YKL40, ASRT7| | 601525 1q32.1  ̄ ̄ ̄ 我有點進去601525的欄位, 裡面有一行 HGNC Approved Gene Symbol:CHI3L1 所以我想要解釋這資料可能跟HGNC有關係。 不知是否是下面我所寫的這樣? 「與精神分裂症有關之基因有OMIM代號601525之項目, 其基因英語慣用代碼為CHI3L1,GP39,YKL40,ASRT7, 惟上述基因命名時有因各國研究系統而有差異, 基本為同一基因, 於HGNC統一命名為CHI3LI, 其餘GP39、YKL40、ASRT7廢棄其名稱。」 請問板上的前輩, 是我想的這樣嗎? 感謝大家。 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 203.64.84.219

07/19 20:58, , 1F
應該不算是廢棄,但是以HGNC的Gene Symbol為標準
07/19 20:58, 1F

07/19 20:58, , 2F
其他的算是別名=alias
07/19 20:58, 2F

07/19 23:32, , 3F
樓上正解, 這些名子代表的都是同一個Gene
07/19 23:32, 3F

07/23 14:07, , 4F
謝謝大家喔^^
07/23 14:07, 4F
文章代碼(AID): #1E9MbFhb (BioMedInfo)
文章代碼(AID): #1E9MbFhb (BioMedInfo)