[問題] 利用SRA資料庫預測siRNA位置
各位生資高手們!小妹有問題,老闆要我利用NCBI上SRA的資料庫(GSO number GSE42966),利用基因序列 ( accession X14591) 做blast預測siRNA並製作下網址paper的圖,但我對這根本不了解,比對資料庫只會跑出35nt的平均序列,我要的21nt序列為何比對不到呢?參數設定也沒看到長度選項@@
最終得到序列後就是要製圖,請問這篇paper的Fig. 5要用什麼軟體製作呢?
http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2164-14-63.pdf
麻煩各位解答,感激不敬!
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