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討論串[工具] PseudoPipe - 找尋 Pseudogenes
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#1
[工具] PseudoPipe - 找尋 Pseudogenes
推噓4(4推 0噓 1→)留言5則，0人參與, 最新作者huggie (huggie)時間16年前 (2008/06/01 14:47), 編輯資訊
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介紹一下找尋 Pseudogene 的軟體：PseudoPipe，最近正接觸這套軟體. ，順便來做個介紹。︿︿. [前言]. PseudoPipe 是 2006 年發表在 Bioinformatics 的軟體。它是一個尋. 找 pseudogene 的套件。要使用這個套件之前，先得對 pseudog
(還有3139個字)
#2
Re: [工具] PseudoPipe - 找尋 Pseudogenes
推噓10(10推 0噓 0→)留言10則，0人參與, 最新作者sysc (I am NTU student)時間16年前 (2008/06/01 15:21), 編輯資訊
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那這個工具最後跑出來的結果的檔名代表的意義是?. 例如我跑某個chromosome Y. 最後出現以下這幾個檔案. chrY.sptrembl.all.fa chrY.sptrembl.dup.gff. chrY.sptrembl.pssd1.fa chrY.sptrembl.pssd2.gff.
(還有86個字)
#3
Re: [工具] PseudoPipe - 找尋 Pseudogenes
推噓4(4推 0噓 6→)留言10則，0人參與, 最新作者sysc (I am NTU student)時間16年前 (2008/06/25 11:48), 編輯資訊
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要怎麼樣才能夠讓這個程式同時跑很多個呢?. 因為我跑兩隻的時候它們會寫入同一個檔案造成. 錯誤. 難道一定要改它的程式嗎?. 我怕一改就漏改. 因為這個一跑就是要1 星期才能跑完的事. 萬一漏改的話一星期後才發現跑錯了. 那一星期就浪費掉了. --. ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc). ◆
#4
Re: [工具] PseudoPipe - 找尋 Pseudogenes
推噓1(1推 0噓 3→)留言4則，0人參與, 最新作者sysc (I am NTU student)時間16年前 (2008/06/26 16:05), 編輯資訊
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現在我已經可以同時跑好幾個了. 不過在跑的時候有個問題~~. 為什麼它CPU 利用度不會吃到滿. 有時候會停在0%. 有時候100%. 感覺起來很奇怪. 這個程式的效率好像非常差. --. ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc). ◆ From: 140.112.26.181.
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