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討論串[程式] 如何利用bioperl去將blastp所得到的結果做分群

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[程式] 如何利用bioperl去將blastp所得到的結果做分群

推噓0(0推 )留言0則，0人參與作者hgsfhevil (evil)時間16年前 (2008/08/16 23:45)資訊

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如題. 我知道很多程式可以處理cluster例如:blastclust 和 cd-hit. 但是我想要直接從blastp產生的輸出格式,直接去做分群. 我已經安裝好bioperl了. @@有一個厚臉皮請求. 可以請有經驗的人直接寫出來給我看嗎. 小弟以前只用c++. 希望根據有經驗的人寫的程式,順便

Re: [程式] 如何利用bioperl去將blastp所得到的結果做分群

推噓0(0推 )留言0則，0人參與作者hgsfhevil (evil)時間16年前 (2008/08/17 21:37)資訊

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這是我在書上看到範例. #! /usr/bin/perl -w. use strict;. use Bio::SearchIO;. my $blast = new Bio::SearchIO(-format => 'blast',-file => $ARGV[0]);. my %Name;. my

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Re: [程式] 如何利用bioperl去將blastp所得到的結果做分群

推噓0(0推 )留言0則，0人參與作者hgsfhevil (evil)時間16年前 (2008/08/17 22:31)資訊

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#! /usr/bin/perl -w. use strict;. use Bio::SearchIO;. my $blast = new Bio::SearchIO(-format => 'blast',-file => $ARGV[0]);. my %Name;. #my $result=$bl

(還有240個字)

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