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討論串[問題] 資料庫中要用哪一股是怎麼定義?
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#1
[問題] 資料庫中要用哪一股是怎麼定義?
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者adu (^_^)時間15年前 (2009/06/17 11:44), 編輯資訊
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想請教版大們，. 由於我現在在處理一些資料，有牽扯到互補雙股的問題. 由於 A <-> G C <-> T. 所以AC的特性會類似GT是可以理解的. 但是又發現AT的數量遠大於GC，變得很多資料都沒辦法解釋. 想請教版大，把哪一股丟上NCBI有沒有特別的定義呢？. 謝謝版大的回答Orz. --. 3
#2
Re: [問題] 資料庫中要用哪一股是怎麼定義?
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者windincloud (雲淡風輕)時間15年前 (2009/06/17 12:42), 編輯資訊
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^^^^^^^^^^^^. 哪樣的資料? 從哪邊取得? ^^^^^^^^^^^^^^^^^. 這邊你指的是? 要將序列轉互補嘛?. 那這樣應該是 A <-> T C <-> G吧~. 若不是的話 那請不要寫 <-> 會讓人起誤會地~. ^^^^^^^^^^^^^^^^. 這邊要看特性吧~ 通常是編碼
#3
Re: [問題] 資料庫中要用哪一股是怎麼定義?
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者adu (^_^)時間15年前 (2009/06/17 13:53), 編輯資訊
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NCBI 人類的genome. 對～是只互補的意思:). 還是沒有很了解. 即便都是5'寫到3' DNA以雙股的方式存在，那究竟會挑哪一股出來表示？. 如 http://bioinfo.cs.ccu.edu.tw/wiki/doku.php?id=transcription. 是挑識別股還是模板股？
#4
Re: [問題] 資料庫中要用哪一股是怎麼定義?
推噓1(1推 0噓 2→)留言3則，0人參與, 最新作者windincloud (雲淡風輕)時間15年前 (2009/06/17 21:14), 編輯資訊
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由你文中~ 我沒有辦法知道你想做啥大事~. 不過基本上 序列寫法都是由5'寫至3'. 也就是說你今天不管到哪個地方下載序列下來~. 最左邊永遠是5'不會變的. 至於挑出哪股來表示. 我想你應該是想說方向性問題吧~. 在所有的ncbi中的資料都會標上方向性及啟始與終止位置. 這樣你就可以了解這條序列來
(還有379個字)
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