Re: [問題] 資料庫中要用哪一股是怎麼定義?
※ 引述《windincloud (雲淡風輕)》之銘言：
: ※ 引述《adu (^_^)》之銘言：
: : 想請教版大們，
: : 由於我現在在處理一些資料，有牽扯到互補雙股的問題
: ^^^^^^^^^^^^
: 哪樣的資料? 從哪邊取得?
NCBI 人類的genome
: : 由於 A <-> G C <-> T
: ^^^^^^^^^^^^^^^^^
: 這邊你指的是? 要將序列轉互補嘛?
: 那這樣應該是 A <-> T C <-> G吧~
: 若不是的話 那請不要寫 <-> 會讓人起誤會地~
對～是只互補的意思:)
: : 所以AC的特性會類似GT是可以理解的
: : 但是又發現AT的數量遠大於GC，變得很多資料都沒辦法解釋
: ^^^^^^^^^^^^^^^^
: 這邊要看特性吧~ 通常是編碼區GC高 非編碼區不一定
: : 想請教版大，把哪一股丟上NCBI有沒有特別的定義呢？
: 所有資料都是5'寫至3'
: 所以當你要丟資料請先確定序列是由5'寫至3'
: 至於互補不互補 BLAST 會幫忙判定的~
還是沒有很了解
即便都是5'寫到3' DNA以雙股的方式存在，那究竟會挑哪一股出來表示？
如 http://bioinfo.cs.ccu.edu.tw/wiki/doku.php?id=transcription
是挑識別股還是模板股？
又以genome的資料來說，不同基因，被轉錄的可能會是雙股中其中一股？
那在這樣的情況下，又會挑哪一股上傳到資料庫呢？
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37m﹡
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