Re: [問題] 電腦模擬蛋白質製藥的需求?

看板Bioindustry (生物科技)作者 (肥仔)時間12年前 (2013/11/21 11:35), 編輯推噓7(7043)
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稍微整理一下目前討論結果 如果想要廠商接受 電腦實現高通量篩選要可行必須有 1. 配體(化合物, 藥物)夠多, 也就是目標應該定在 縮小傳統HT的範圍. 2. 由於目標是1 所以速度必須遠高於廠商能夠取得的HT機器之速度. 3. 由於是縮小傳統HT的範圍故價格要低於縮小HT範圍所得到的價格效益 但是, 如果另一方向想, 如果 能找到一個各方人才的團隊(主要是生技, 資訊人員) 開發出目前市面上疑難雜症的藥物, 該症目前可能宣稱為不治之症或慢性病 當然, 不可能是治癒, 但是理論上可以控制. 舉例說明: 紅斑性狼瘡, 第二型糖尿病, 痰湿型肥胖症 該藥物群"僅"通過電腦篩選. 這樣, 這些資料是否有市場呢? ※ 引述《s122s91 (lo)》之銘言: : 如果你用現在上市的藥, : 用電腦模擬去算,分數一定不是最高的 : 如果把電腦設定成"上市藥物"為最高分的參數,拿來跑,設計出來的藥物,活性通常不高 : 我想這就是困境。 : 不知道到現在為止,有沒有藥物是真的由模擬出來的。 : 電腦模擬就是模擬,不一定準。 : ※ 引述《piimaila (肥仔)》之銘言: : : 想請問, 蛋白質製藥預測的整體解決方案 : : 例如: : : 利用電腦軟體預估 以下課題 : : 多醣體抑制癌症能力(中研院) : : 這種是否有實用性和市場? : : 或市面上已經有類似廠商? : : 當然, 這只是預測, 不可取代人體實驗 動物實驗等 : : 但可以大量的減少實驗範圍. : : 弊人想投資類似公司, 但是由於才疏學淺 : : 故來此詢問各位先進和專家, 這類型的服務是否有前景呢? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 172.245.16.16

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我還沒看過沒有做過動物實驗的藥有藥廠會買的。
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如果你們可以在不增加細胞或動物實驗的成本的前提之下,
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利用modeling找出有效的小分子,這樣就有獲利的機會啦。
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但我覺得要想想,你要用的是套裝軟體,用的database也不外
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乎是MDL,NCI,SPEC等等常用的,你的target要有市場的話大
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概也不會是什麼冷門的標的,我是不覺得藥廠是完全沒作過
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我倒不會這樣想,我預設他們有特殊的方法可以看到別人沒看過
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的東西。但是如果只是買設備和軟體回來想做modeling代工...
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或許對一些國內的小藥廠甚至大學裡面需要多一個DATA用來增加
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paper內容的實驗室會比較有吸引力。
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做一次modeling收個5萬,給出10幾種compound讓研究生去try
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只要看到效果就好,micromole級的EC50也不在乎 XD
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Amgen一個計畫他們的computing candidate有上千個 真的
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*micromolar
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到了in vivo可能再narrow down到30個 為什麼有這種差異
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就是因為無法預測毒性 安定性 溶解度等等的問題
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如果你們的系統準確率很高 連這些都可以做預測
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那價值才有辦法做出來 不然花大錢組個團隊後面效益可能
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不高 需要好好考慮...
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PK,ADMET等等的問題太多了,真能找到一個lead還真是難阿
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溶解度有的時候是要看是誰在做 XD
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只是其一嘛 XD 模擬跟實際在目前來說差異還是很大
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給您參考
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基本上毒性 溶解度等等倒不是問題~雖然不太好說
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但是 基本上能出來的資料除了驗證效果外. 無毒, 可吸收
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倒是可以保證
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當然啦, 我指的是普通人不是問題, 病人就...不太確定
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簡單的說, 就是利用傳統食品內純化的東西下去做預測
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並簡單的計算劑量和藥物預測這樣
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當然啦, 我是搞電腦的, 其他的東西我不太懂@@
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我這裡只是處理高速運算. 生技問題我不太想讓我的合夥人
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知道我在非常猶豫(當然他不上ptt 不看中文..所以才來這問
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)^^~~
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其實你如果可以提供他們的paper 大家就可以告訴你他是有
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獨門技術還是靠套裝軟體砸出來的
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我去問問...
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上次聽有人講所謂生技創投金主就是3F Friend Family Fool
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建議當做買bit幣差不多 買了就放著 放著就忘了吧
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bit幣~漲翻了大哥
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我有陣子也在玩 小賺一點, 但現在摸都不能摸
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還有 事實上我投入不太多, 只是改程式和架設高速Server
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出一點k20而已 bit幣時代殘存的雜物 拿來用用這樣
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而且 我是覺得他們的東西 基本上可行 可行的原因
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是根本不是新藥 只是新應用而已
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簡單的說 治療一些奇怪病症的藥 根本早就有
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只是沒人拿來治療那些病症 當然 我只說電腦預測可以
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實際上是未知的...
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我是說請把這次投資當作跟bit幣同等風險的等級
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bit幣是有漲沒錯 但不代表同等風險的都一定會成功
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