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討論串[問題] primer design問題
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#3
Re: [問題] primer design問題
推噓1(1推 0噓 0→)留言1則，0人參與, 最新作者Mouseking (叫我老鼠王....-_-)時間19年前 (2006/11/06 22:04), 編輯資訊
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真的會有一堆嘛？你有沒有選定物種？還有正反股不在同一染色體上....抑或隔很遠. 也是不必理會它......... 3'-端的幾個BASE確實很重要，我的經驗是挑至少看3個BASE挑有G或C的. --. ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc). ◆ From: 210.58.54.177.
#2
Re: [問題] primer design問題
推噓0(0推 0噓 1→)留言1則，0人參與, 最新作者kaifish (喔.....................)時間19年前 (2006/11/06 19:12), 編輯資訊
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提供一點小小的經驗給您參考. 其實Blast出來的片段雖然很相似. 但是可以看看〝完全一樣〞或是3'端相似的比例有多少. 如果3'端一樣的比例很少，那麼設計出來的primer有時候還是可以使用的. 另外，也許你可以去看一下那些完全一樣的序列. 有時候不會以基因的名字表示. 而是以當初做定序的clon
(還有30個字)
#1
[問題] primer design問題
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者limiya (陳小咩)時間19年前 (2006/11/06 14:47), 編輯資訊
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我想請問. 我利用一個軟體叫做Beacon_designer設計primer. 然後跑出一推primer candidate後再去blastn看是否這個primer會和其他的sequence. 我的問題是. 通常拿去blast的小片段primer sequence會blast到一堆其他的gene s
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