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[問題] Basic folding alg. 比對問題

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者 (雲淡風輕)時間16年前 (2008/10/31 14:40), 編輯推噓0(0推 0噓 0→)
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今天我利用Basic Folding Algorithm http://bioinf.kvl.dk/~gorodkin/teach/bioinf2004/talk4_nov5.pdf 想找出一條seq.自我pair的狀況 但是今天我在trace back時會有非我要的配對出現 也就是原先我要AT、CG、GT這三種pair 但是出來的結果會有AA或CC CA這樣奇怪的配對出現 這樣的話 我應該如何處理? 有人有經驗嘛? ---- ps. 由於我不須要知道是否有branch 所以我把branch判斷拿掉 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.138.155.195
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