[問題] BLAST 2.2.23+

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者 (等待奇蹟....)時間14年前 (2010/06/09 15:35), 編輯推噓0(000)
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想用裡面blastn的工具,尋找在設定資料庫中,以比較寬鬆的限制 尋找和guery sequence相似度沒那麼高的,比方說設定相似度只有70%以就全部例出 那個參數要怎麼下會比較好? 我已經試過裡面-perc_identity這個參數 output還是和我想像有點差距,找出來的sequence比預期的少 不知道其他已經用過BLAST 2.2.23+裡blastn這個工具的大大有什麼建議可以提供小弟做參考? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 203.65.71.253
文章代碼(AID): #1C3qHSpb (BioMedInfo)
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