Fw: [求救] 有人用過miREADER軟體找 novel miRNA嗎

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者planter (黑洞)時間11年前 (2013/08/07 17:03)推噓0(0推 0噓 0→)

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※ [本文轉錄自 Biotech 看板 #1I0IDidU ] 作者: planter (黑洞) 看板: Biotech 標題: [求救] 有人用過miREADER軟體找 novel miRNA嗎時間: Wed Aug 7 00:24:59 2013 哈囉大家好我最近看了一篇pape說他們的軟體可以不用基因體全定序或transcriptome 只憑small RNA deep sequencing就可以預測novel RNA PLoS One. 2013 Jun 21;8(6):e66857. Print 2013. miReader: Discovering Novel miRNAs in Species without Sequenced Genome. 他們的網站還有提供下載和簡單的教學 http://scbb.ihbt.res.in/2810-12/miReader.php 由於我手上沒data 所以利用教學中提到的檔案逐步做練習 input調miReader_dicot.jar output隨便設一個資料夾在桌面 number of processors(應該是處理器的數目)輸入1跟2都試過參考物種選阿拉伯芥結果怎麼跑目標資料夾都是空的，而且進度都直接100%，像沒跑一樣。所以想上來問問看有沒有用過的學長姊們可以分享一下用嗎謝謝大家 -- 如果我們要把磁鐵棒放進線圈，　　線圈會說「不!!不要過來!!」而發出阻力不讓磁鐵棒靠近。　但是如果我們要把放進去的磁鐵棒從線圈拿走，　　　　　　　　「傲嬌是一種　線圈反而會說「我…我又沒有叫你走!!」而發出阻力不讓磁鐵棒離開。　　自然現象」　這種現象不就是傲嬌嗎！　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　新科科人雜誌　所以傲嬌這東西根本不是新梗，19世紀就有科學家發現傲嬌了。　　　　　／民明書房 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.52.104