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討論串[問題] 預測基因存在的工具
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#1
[問題] 預測基因存在的工具
推噓0(0推 0噓 2→)留言2則，0人參與, 最新作者leondemon (狗狗)時間16年前 (2008/12/05 18:12), 編輯資訊
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請問一下要某一細菌或古細菌的基因體序列（genome sequence). 那要預測有多少基因「確實存在」 哪個生資軟體的正確率比較高？. 目前我知道的有GLIMMER 它標榜著有97~98%的預測準確度. 請問一下還有哪些類似的優秀軟體呢？. --. ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc).
#2
Re: [問題] 預測基因存在的工具
推噓2(2推 0噓 21→)留言23則，0人參與, 最新作者auymle (.....)時間16年前 (2008/12/06 00:05), 編輯資訊
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我對這個領域比較不熟. 但我知道有幾篇prediction method的比較. A brief review of computational gene prediction methods.(2004). http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15901250.
(還有255個字)
#3
Re: [問題] 預測基因存在的工具
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者hgsfhevil (evil)時間16年前 (2008/12/16 22:42), 編輯資訊
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FGENESH (Fgenesh predicted results were used as default working gene models in the automated annotation)Genemark.hmm (rice). Genscan (Maize). Genscan+
(還有11個字)
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