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[程式] 使用R cluster 處理microarray資料
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#1
[程式] 使用R cluster 處理microarray資料
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作者
hermeslu
(左慈)
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16年前
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(2009/02/12 06:44)
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想問大家一個問題,. 我的狀況是資料比數太大,. 使用hclust,將資料as.dendrogram,再str看結果,. 可是資料太大即使捲軸在最高,. 分群結果還是無法從頭開始。. plot更慘,完全擠在一起,根本看不出結果。. 圖片.
http://rbbs.biosino.org/Rbbs/p
(還有19個字)
#2
Re: [程式] 使用R cluster 處理microarray資料
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作者
hgsfhevil
(evil)
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15年前
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(2009/05/12 15:29)
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用Mev去繪圖. 有人知道要怎麼把中間,一大區塊的彩色圖片移除掉嗎,. 我主要是要看label(row,or gene)的分群. 這樣的作法,根本看不到gene. --.
※
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批踢踢實業坊(ptt.cc)
. ◆ From: 140.138.155.193.
#3
Re: [程式] 使用R cluster 處理microarray資料
推噓
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作者
hgsfhevil
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15年前
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(2009/05/13 20:57)
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http://www.wretch.cc/album/show.php?i=hgsfhevil&b=2&f=1516295336&p=0.
我放在這裡面,不過他把我縮圖了. 我主要是把中間那快移除掉,我只要是看他clust什麼. 不是看那花花綠綠的東西. --.
※
發信站:
批踢踢實業坊(ptt.
#4
Re: [程式] 使用R cluster 處理microarray資料
推噓
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2則,0人
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作者
hermeslu
(左慈)
時間
15年前
發表
(2009/05/14 20:43)
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你可以選擇部分的分支,然侯你會看到分支會變色,. 原來是黑色,被選擇後會變紅色,. 滑鼠右鍵save cluster,存成.txt file,. 然後用ie or firefox開啟檔案. 就可以了. --.
※
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批踢踢實業坊(ptt.cc)
. ◆ From: 115.64.8.114.
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