[程式] 使用R cluster 處理microarray資料

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者 (左慈)時間16年前 (2009/02/12 06:44), 編輯推噓2(205)
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想問大家一個問題, 我的狀況是資料比數太大, 使用hclust,將資料as.dendrogram,再str看結果, 可是資料太大即使捲軸在最高, 分群結果還是無法從頭開始。 plot更慘,完全擠在一起,根本看不出結果。 圖片 http://rbbs.biosino.org/Rbbs/posts/list/756.page 想問版友: 1. 有沒有指令可以將分群結果輸出成 .txt ? 2. 或者其他分群package有包含可將分群結果輸出的指令? 重點就是 我該如何得到分群結果。 先謝謝大家,等待好消息 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 149.171.224.229

02/12 16:52, , 1F
你要不要用cluster 3.0搭配Java TreeView來做
02/12 16:52, 1F

02/12 16:52, , 2F
或是用GAP等clustering的軟體來做
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02/12 16:55, , 3F
至少這些工具visulization的部分比較好
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02/13 10:43, , 4F
樓上提到的 有整合在MeV裡 個人覺得還不錯用
02/13 10:43, 4F

02/13 17:02, , 5F
謝謝 我試試cluster3.0 什麼是MeV
02/13 17:02, 5F

02/13 18:51, , 6F
google key word: MeV <--第一筆就是了
02/13 18:51, 6F

02/17 15:04, , 7F
MeV太讚 真是好用 謝謝樓上所有人
02/17 15:04, 7F
文章代碼(AID): #19arJ6Pd (BioMedInfo)
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