討論串[工具] 想請問MicroRNA Target Prediction
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推噓0(0推 0噓 0→)留言0則,0人參與, 最新作者Phaeton (凰呀的鳴叫~)時間15年前 (2009/12/14 20:42), 編輯資訊
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網路上google後 看到幾個比較常用的. TargetScan. http://www.targetscan.org/vert_40/. MicroRNA.org. http://www.microrna.org/microrna/home.do. PicTar. http://pictar.md
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推噓1(1推 0噓 1→)留言2則,0人參與, 最新作者hajimels (阿一)時間15年前 (2009/12/15 00:56), 編輯資訊
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首先呢 我假設你已了解miRNA是如果去binding他的target和其調控機制. miranda 的prediction方式 是以base-pairing 計算其最低能階(亦是最安定)的情況. 另外 此演算法是不考慮所謂的seed region的. 相反地 TargetScan的演算法上是有考慮
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