[工具] 想請問MicroRNA Target Prediction
網路上google後 看到幾個比較常用的
TargetScan
http://www.targetscan.org/vert_40/
MicroRNA.org
http://www.microrna.org/microrna/home.do
PicTar
http://pictar.mdc-berlin.de/
我自己是用了一些已知的Human cell cycle相關基因去測試
比方說 BRCA1 BUB1B CCNE1 當然還有其他的
可是常常會看到 有database是no results 有的是預測的結果不同
MiR target到mRNA上
我記得是認其3'UTR
可是結果為什麼會有這種差異
總覺得應該要predict出來的microRNA應該會有些許的重複
比方說BUB1B在microRNA.org有let7c 但是TargetScan又沒有
請問是我那裡的觀念有錯誤?
謝謝
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