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討論串來玩玩真的問題好了(原Re: [公告] 新增版規第二條)
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來玩玩真的問題好了(原Re: [公告] 新增版規第二條)
推噓1(1推 0噓 3→)留言4則，0人參與, 最新作者lingon (林果)時間12年前 (2012/04/06 21:08), 編輯資訊
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我先拋磚引玉先丟個實際遇到的問題讓大家討論看看. 要不然整天只剩上世紀的問題跟要paper 也不是辦法. 今天我有十對Tumor/Normal sample pair for cancer X, fresh tissue. 已經製造了如下:. 1. 兩對 full genome sequence.
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#2
Re: 來玩玩真的問題好了(原Re: [公告] 新增版規第二條)
推噓2(2推 0噓 3→)留言5則，0人參與, 最新作者hajimels (阿一)時間12年前 (2012/04/07 19:14), 編輯資訊
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請問上述的sample應該是對應的吧?. 看你有提到RNA editing, 應該是有吧?. 另外有做sequening的同時, 不知道你們的coverage有多少?. 因為coverage決定了能做多少的分析. 而且你們上述的data都是不同層次的 可以垂直整合. 每個層次都是切入點. 例如 DN
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#3
Re: 來玩玩真的問題好了(原Re: [公告] 新增版規第二條)
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者YMLS (流逝於指縫的沙)時間12年前 (2012/04/08 02:27), 編輯資訊
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由於不清楚原po的實驗動物是否具有reference，所以以下均以沒有reference來看待~. CNV, non-synonymous SNP, (large, small, non-synonymous) INDEL,. Structural variation, Gene predictio
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