來玩玩真的問題好了(原Re: [公告] 新增版規第二條)

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者 (林果)時間12年前 (2012/04/06 21:08), 編輯推噓1(103)
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我先拋磚引玉先丟個實際遇到的問題讓大家討論看看 要不然整天只剩上世紀的問題跟要paper 也不是辦法 今天我有十對Tumor/Normal sample pair for cancer X, fresh tissue 已經製造了如下: 1. 兩對 full genome sequence 2. 一對 (Tumor/Normal) RNASeq transcriptome 3. 三對 full genome Methylation array 4. 兩對 mRNA array 目前除了做CNV detection, Differential expression 等較平常的分析外 還開始看RNA editing, 除此之外, 不曉得大家有什麼其他可以切入的角度 來分析這份資料? ※ 引述《hajimels (阿一)》之銘言: : 其實這邊反應著台灣做研究的人對於生資這個領域的態度 : 生資 = Array.new : 生資[0] = "blast" : 生資[1] = "ncbi找sequence" : 生資[2] = "電腦" : 生資[3] = "???" : 生資.each do |ability| : print "我有一個同學在做生資的,他應該會"+ ability : end : 以上..... : ※ 引述《huggie (huggie)》之銘言: : : 大家好 : : 新增版規第二條,徵求 paper 的文章請在七天內自行刪除。 : : 沒刪除的話,我看到會幫刪 (不會給劣文)。 : : 如果刪除後仍有需要,請麻煩再貼文囉。 : : 從明日起開始實施,對這條版規有意見的話請發表 : : (應該沒有人會有吧?! :p ) 謝謝。 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 155.52.120.143 ※ 編輯: lingon 來自: 155.52.120.143 (04/07 06:01)

04/09 18:54, , 1F
刷SNP的case-control study , 但樣本數太小
04/09 18:54, 1F

04/09 18:55, , 2F
NGS 能組出 [miRNA] 的資料嗎?
04/09 18:55, 2F

04/09 22:47, , 3F
Rseq若是用poly A enrichment的話,頂多看到precursor
04/09 22:47, 3F

04/09 22:48, , 4F
用Ribominus才有機會吧 但是又要扯到abundance的問題了。
04/09 22:48, 4F
※ 編輯: lingon 來自: 155.52.120.143 (04/09 23:39)
文章代碼(AID): #1FVkh0Vz (BioMedInfo)
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