Re: 來玩玩真的問題好了(原Re: [公告] 新增版規第二條)
由於不清楚原po的實驗動物是否具有reference，所以以下均以沒有reference來看待~
※ 引述《lingon (林果)》之銘言：
: 我先拋磚引玉先丟個實際遇到的問題讓大家討論看看
: 要不然整天只剩上世紀的問題跟要paper 也不是辦法
: 今天我有十對Tumor/Normal sample pair for cancer X, fresh tissue
: 已經製造了如下:
: 1. 兩對 full genome sequence
CNV, non-synonymous SNP, (large, small, non-synonymous) INDEL,
Structural variation, Gene prediction + blastp, GO, KEGG,
fusion gene
: 2. 一對 (Tumor/Normal) RNASeq transcriptome
同第一點之外，還可以加上alternative splicing,
: 3. 三對 full genome Methylation array
: 4. 兩對 mRNA array
對array不熟...
: 目前除了做CNV detection, Differential expression 等較平常的分析外
: 還開始看RNA editing, 除此之外, 不曉得大家有什麼其他可以切入的角度
: 來分析這份資料?
原po應該是做NGS的吧？一些NGS相關的資料可以到以下網站看看... :D
http://yourgene.pixnet.net/blog
網頁文章會不定期更新～
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.113.3.112
※ 編輯: YMLS 來自: 140.113.3.112 (04/08 02:29)
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