討論串[問題] 有關Real-time PCR 數據分析
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我現在手上有一種未知功能的蛋白質. 已經有這個蛋白的 KO mice. 老闆要我取 wild-type and KO mice 不同器官的RNA跑RT-PCR. 比較相同器官中 WT and KO mice 這個蛋白基因的表現量. 但跑完後我不清楚數據要如何分析. 因為沒有一個 wt and KO
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例如說. 螢光亮度_肝臟: WT-X(100) KO-X(75) WT-GAPDH(300) KO-GAPDH(500). X對GAPDH做校正 定WT-X仍為100 KO-X校正後為45. 如果要比不同器官 感覺應該要跑在同一塊膠 才可以把某一器官當1. 關於三重複 是有三隻小鼠 三個肝臟 三管R
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很多人是用你要看的基因,跟GAPDH算出差值. 用Relatvie的概念去做Normalization. 但我習慣以下方法:. 1. 先把GAPDH在sample中的Ct值 放在一起看 是否差不多?. 一般來說Ct值不會差很多,除非你這個蛋白會直接影響到跟cytoskeleton相關的. pathw
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