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討論串[求救] 蛋白質3D結構
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#4
Re: [求救] 蛋白質3D結構
推噓3(3推 0噓 16→)留言19則，0人參與, 最新作者showponn (showpon)時間18年前 (2008/02/26 11:50), 編輯資訊
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感謝lingon大、WilliamF大、McRay大熱情回答. 我目前有去PDB跟NCBI找過. 發現得到的結構資料都是類似這樣. THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE ESTROGEN RECEPTOR DNA-BINDING DOMAIN. BOUND TO DNA: HOW
(還有247個字)
#3
Re: [求救] 蛋白質3D結構
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者McRay (西施就是愛的天使)時間18年前 (2008/02/26 10:07), 編輯資訊
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這邊的complex是指protein-nucleotide or protein-protein 的複合體. 還是指一個PDB file裡面許多組座標都是表示同一個蛋白或是複合體?. --. ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc). ◆ From: 140.116.94.251.
#2
Re: [求救] 蛋白質3D結構
推噓0(0推 0噓 0→)留言0則，0人參與, 最新作者WilliamF (W.F.)時間18年前 (2008/02/26 00:06), 編輯資訊
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我之前有學到幾套電腦軟體: PyMOlL Cn3D spdbv Chimera. 這些都可以顯示化學結構的立體結構 還可以轉. 不過要上網下載序列 好像是NCBI吧........ 詳細我也沒有摸的很熟 不知道對你有沒有幫助. 以上. --. ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc). ◆ Fro
#1
[求救] 蛋白質3D結構
推噓1(1推 0噓 2→)留言3則，0人參與, 最新作者showponn (showpon)時間18年前 (2008/02/25 21:33), 編輯資訊
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通常要取得蛋白質3D結構資料的時候. 很普遍的工具是Protein Data Bank這個資料庫 可以取得原子三維座標的資料. 但是在使用過後我發現PDB裡的結構都是屬於complex. 而不是以單一蛋白質為單位的資料. 希望可以知道 有沒有什麼工具或是資料庫 有提供以單一蛋白質為單位的蛋白質結構資
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