[求救] 蛋白質3D結構

看板Biotech (生命科學)作者 (showpon)時間18年前 (2008/02/25 21:33), 編輯推噓1(102)
留言3則, 1人參與, 最新討論串1/4 (看更多)
通常要取得蛋白質3D結構資料的時候 很普遍的工具是Protein Data Bank這個資料庫 可以取得原子三維座標的資料 但是在使用過後我發現PDB裡的結構都是屬於complex 而不是以單一蛋白質為單位的資料 希望可以知道 有沒有什麼工具或是資料庫 有提供以單一蛋白質為單位的蛋白質結構資料 雖然知道從complex也可以找到我要的蛋白 不過我的實驗是需要大量的蛋白質去做計算 沒有辦法從PDB一個一個去看 希望大家可以幫幫忙摟 感謝感謝 如果問題問的不好 還請見諒 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 125.229.14.219

02/26 00:13, , 1F
找找看mmtsb toolset 裡面有沒有這個功能
02/26 00:13, 1F

02/26 00:16, , 2F
沒有的話, 自己寫個script把rmsd 差最少的monomer從file
02/26 00:16, 2F

02/26 00:17, , 3F
中抓出來. 反正都是txt file, 這種script 不難
02/26 00:17, 3F
文章代碼(AID): #17miENjB (Biotech)
討論串 (同標題文章)
文章代碼(AID): #17miENjB (Biotech)