[問題] 有關Ka/Ka ratio的問題 >"<
最近開始接觸comparative genomics
目前在玩Ka/ks ratio
試過PAML ( http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html#introduction )
搞了很久.. 搞不定
後來發現Bioperl也能做 自己coding完 還是有問題=.=
最後我選擇了這個 Selection ( http://selecton.tau.ac.il/overview.html )
不知道有沒有板友有類似經驗的呢?
我今天想做的是protein A
從低等到高等物種中 到幾是哪個物種X->物種Y 產了positive selection
希望大家討論一下囉~
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★ミ ζ
○_.
/(╯
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