Re: [問題] 請問有無方便的程式或方法可幫我解決難 …
※ 引述《enisx (東方有比目魚,不比不行)》之銘言：
: 請教各位高手,
: 我手上有外送回來定序的DNA序列文字檔(.txt)
: 裡頭大約有約700-1000條,檔案已經轉成FASTA格式了,
: 但是,我想從每條DNA序列中"擷取"出我想要的部份,
: 舉例如下:
: -------------------------------------------------------------
: >123456
: TACCTCTGTGCTGTGGGGCGGATCTGAAAAGCTGGTCTTT
: → hgsfhevil:c++也可以用這樣的東西去做嗎? 08/01 14:03
: → alpe:晚上來 release win 下的執行檔好了 08/01 18:13
http://www.uploadpedia.com/19Q94XWLMLGH/seq-rar.html
seq.rar => seq.exe
test
>123456
TCAXXXXXXXXXXXXXXXTTTTCAXXXXXXXXXXXXXXXTTTTCAXXXXXXXXXXXXXXXTTT
TCAXXXXXXXXXXXXXXXTTT
test2
>123456
TCAzzzzzzzzzzzzzzzTTTTCAzzzzzzzzzzzzzzzTTTTCAzzzzzzzzzzzzzzzTTT
TCAzzzzzzzzzzzzzzzTTT
D:\>seq '(TCA.*?TTT)' test test2
Create By Mervyn Wang 2008.07.31.
(TCA.*?TTT)
File: test
-------------------------
1 : TCAXXXXXXXXXXXXXXXTTT
2 : TCAXXXXXXXXXXXXXXXTTT
3 : TCAXXXXXXXXXXXXXXXTTT
4 : TCAXXXXXXXXXXXXXXXTTT
File: test2
-------------------------
1 : TCAzzzzzzzzzzzzzzzTTT
2 : TCAzzzzzzzzzzzzzzzTTT
3 : TCAzzzzzzzzzzzzzzzTTT
4 : TCAzzzzzzzzzzzzzzzTTT
好像應該要寫一個 output 到file 的 參數的... ...
--
Exactly. For that one fraction of a second, you were open to options
you had never considered. THAT is the exploration that awaits you:
not mapping stars and studying nebulae,but
charting the unknown possibilities of existence.
Star Trek S7E26 "All Good Thing"
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 59.121.121.35
※ 編輯: alpe 來自: 59.121.121.35 (08/02 01:19)
→
08/03 18:22, , 1F
08/03 18:22, 1F
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完整討論串 (本文為第 4 之 5 篇)：
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