[問題] mice跟human的DNA序列要怎麼用NCBI比對???

看板Biology (生物學)作者 (布蘭妞)時間16年前 (2009/09/22 22:49), 編輯推噓1(101)
留言2則, 1人參與, 最新討論串1/1
【問題】:想請問怎麼用 NCBI 比對 mice 跟 human 的 CD44 DNA sequence? 【問題起因】: 學姊很兇我不敢問... 因為已經有PAPER指出說人類的腫瘤細胞有 CD44+ 的 CELL surface marker 所以想說找看看mice的腫瘤細胞裡是不是同樣也有 CD44+ 學姊就要我去比對人類跟小鼠的 CD44 DNA sequence,如果相似性很高的話, 就可以採用paper的辦法去鑑定 【個人看法】: 我有用 NCBI 的 "nucleotide" 搜尋 "CD44" 可是跑出來好多 NM______ NG_____ A______ L_______ 這類東西 還有variant甚麼的 像這樣的 NM_009735 Mus musculus beta-2 microglobulin (B2m), mRNA gi|144227219|ref|NM_009735.3|[144227219] NM_001142924 Mus musculus transcription factor 7-like 2, T-cell specific, HMG-box (Tcf7l2), transcript variant 8, mRNA gi|218931197|ref|NM_001142924.1|[218931197] NM_001039151 Mus musculus CD44 antigen (Cd44), transcript variant 3, mRNA gi|85540467|ref|NM_001039151.1|[85540467] AY262758 Mus musculus hyaluronan and proteoglycan link protein 4 (Hapln4) mRNA, complete cds gi|30349290|gb|AY262758.1|[30349290] 我都看不懂 我不知道該選哪個才對... 請問他列出來的這一些都表示甚麼樣的意思阿 @@?? 可以告訴我該怎麼使用這個嘛???拜託~ 謝謝!! 非常感激!!! >"< -- 您有想清掉的雜物嗎? 太多用不著、丟掉又可惜的東西想找個好歸宿? , , 穿不下的衣服、用不到的文具、玩具、娃娃、贈品堆太多不知怎處理嗎? 歡迎來Ptt-Charity公益板逛逛,將可用的物資捐給有需要的單位, ╰ *** 讓您不需要的東西,給最需要的人珍惜,既清空間又可做好事,一舉數得! /\ 市民廣場 → 3.PttAction → 3.PttActivity → 3.Ptt-Charity 公益板邀您一起做公益! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 203.72.80.162

09/23 00:29, , 1F
ncbi拿來比對不如下載(免費)程式(Bioedit之類的)好用
09/23 00:29, 1F
文章代碼(AID): #1AkEG01k (Biology)
文章代碼(AID): #1AkEG01k (Biology)