[問題] 生物移動軌跡

看板Biology (生物學)作者 (芭樂就是芭樂)時間11年前 (2014/03/27 00:29), 編輯推噓4(409)
留言13則, 4人參與, 最新討論串1/1
【問題】: 想請問各位前輩, 有沒有什麼軟體可以達到分析多顆且自動分析生物移動軌跡, 或是有用過mosaic的前輩可以指點我一下, 謝謝。 【問題起因】: 我是非生物相關科系的學生, 因為實驗上的需要知道浮游生物在流場中的運動軌跡, 目前我使用imagej的mosaic來分析, 這是一個免費軟體, 好處是可以一次分析很多個生物, 而且能自動化(不需要一個一個點)的將生物的位置連成軌跡, 但是我分析出來的結果都相當的差, 歸咎原因可能是生物濃度太高, 以及生物隨著流場變化在顯微鏡下大小會略有差異, 所以軟體不容易分辨哪一顆是由哪一顆移動而成。 【個人看法】: 【參考資料/連結】: -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 61.230.143.115 ※ 文章網址: http://www.ptt.cc/bbs/Biology/M.1395851347.A.082.html

03/28 04:59, , 1F
你問問看婦產科有沒有精蟲運動分析的軟體
03/28 04:59, 1F

03/29 07:18, , 2F
付費版本,我是有選項啦
03/29 07:18, 2F

03/30 15:42, , 3F
particle tracking 的論文應該滿多的 查看看吧
03/30 15:42, 3F

03/30 15:43, , 4F
主要還是要看你的影片 清晰度跟運動速度快不快等等
03/30 15:43, 4F

03/30 22:07, , 5F
其實我的影片清晰度還算好,但是particle有大有小,另外
03/30 22:07, 5F

03/30 22:08, , 6F
particle的速度蠻快的,而且量又蠻多的,所以很困擾。
03/30 22:08, 6F

03/31 06:21, , 7F
這裡的演算法大致分兩型,使用重疊來追蹤物件,
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03/31 06:22, , 8F
或是使用物件在兩個 frame 間的移動最小化來推測軌跡
03/31 06:22, 8F

03/31 06:23, , 9F
所以關鍵是你的兩個frame之間,物體有沒有重疊?
03/31 06:23, 9F

03/31 06:23, , 10F
還是移動已經快到跑到別地方了?
03/31 06:23, 10F

03/31 21:57, , 11F
我這裡是有使用過cellsens 的Tracking 可自己去圈選要
03/31 21:57, 11F

03/31 22:08, , 12F
兩個frame之間物體沒有重疊
03/31 22:08, 12F

03/31 22:11, , 13F
因為流場的流動相較於生物自己的游動快很多。
03/31 22:11, 13F
文章代碼(AID): #1JCm1J22 (Biology)
文章代碼(AID): #1JCm1J22 (Biology)