[問題] otu分析

看板Biology (生物學)作者 (chengyi^^)時間7年前 (2017/06/27 15:52), 編輯推噓1(104)
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【問題】: 最近老闆給的新工作關於腸道維生素 其中有個各個sample 的n個otu 的table 有標記每個otu的界門綱目科屬種 想請問該怎麼做分析呢? 【問題起因】: 有看到很多paper會計算a diversity 、b diversity 、unifrac distance 等 但還是不知道怎麼從otu表格轉換 進而進行後續分析 【個人看法】: 不知道是不是要用軟體進行 還是R package可以使用,再麻煩厲害的高手相助 謝謝 【參考資料/連結】: -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 211.76.175.169 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biology/M.1498549966.A.11B.html

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.html
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有Shannon, Simpson,Reciprocal Simpson Index
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目前我的經驗只有這個網站有使用者介面 其他的要寫R 寫
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R是最佳解
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文章代碼(AID): #1PKWxE4R (Biology)
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