Re: [討論]protein-protein interaction
※ 引述《aggaci (五子棋啦)》之銘言:
: ※ 引述《HIbaby (嗨北鼻)》之銘言:
: : 我都用ip啦 同實驗室的學長 有人用GST 有人用yeast two hybrid
: : 不過我不知道 你說的物化方法是哪些 可以舉個例嗎
: : 印象中 有用生物趕測器的方式 來測蛋白質和受體間的結合力
: 你說的應該是SPR~~
: : 當結合以後 會有微電極產生
: : 可以比較精確測得binding的強弱
: : 這算物化法嗎? 如果你有興趣 我再找相關paper給你看
以biophysic 的方法來做protein protein interaction 主要有
SPR (BIACORE)
與目前全台灣極少數實驗室所有擁有的技術 (包含本實驗室共三間)
AUC (analytical ultracentrifugation)
上述兩者可以確切指出兩者 protein 的作用力的數值
與一般 molecular biology 所使用的 pull down assay
yeast two hybrid 比起來, 以上 biophysic 方式給的是數值
而分生方式給的比較是大略的 yes or no,..比較模糊的概念
但各有所長
不代表biophysic 比較高干 (如上入兩種方法都不能解決in vivo的問題)
但若是其他 physical chemistry 的方式還有很多種
如 ESR , fluorescence 等等...
其他近似比較偏化學或物理的方法還有 gel filtration , native PAGE,
mass, NMR, chemical cross linking 甚至 EM (electrol microscopy).....等等等
都有人應用在protein protein interaction 上面
但都需要有其他的方式加以證明
有人有興趣嗎? 本實驗室歡迎你...................
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