Re: [問題] 有沒有畫出蛋白質二級結構的軟體?

看板Biotech (生命科學)作者cuteuu (888)時間20年前 (2005/02/28 16:41)推噓0(0推 0噓 0→)

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※ 引述《ubiquitin.bbs@nculs.twbbs.org.tw (goodday)》之銘言： : ※ 引述《goodmandy.bbs@ptt.cc (我要當乖小孩了)》之銘言： : > 請問有可以自己打入sequence : > 然後模擬二級結構的軟體嗎 : > 我現在是用swiss pdb viewer : > 但只能看在pdb有檔的protein : > 我想看點突變以後的二級結構 : > 有辦法看嗎 : > 希望有好心人士可以回答我 : > *^____________________________^* : > 謝謝 : spdbv : 其實有突變以及重計能量的功能 : 1. 按" mutate" : 2. 選一安機酸 , 並選擇要變成啥 : 3. tool 選項選擇 energy minimisation : 這樣就可以了 : 但是我覺得沒啥用 : 因為主要結構本來就決定 : 不會有太大改變 : 如果說要將一條序列完全重新計算能量 : 一般抓的到軟體應該做不來吧我知道有個國外網站 SWISS-MODEL http://swissmodel.expasy.org//SWISS-MODEL.html 這是利用網路連接的蛋白質結構模擬的伺服器來進行三維結構的同源模擬應該是目前可以找到的模擬蛋白質結構的最方便的方法.... 這個網站他是把目前已解析完結構的蛋白質與蛋白質序列作個整理依序列去預測可能的蛋白質結構..... 所以你只要丟出序列...然後它就會回e-mail給你..... 告訴你可能的結構為何..... 不過他的準確性仍有待商確.....(如果很準確的話..我們做結構的早就沒飯吃了)... 這個網站詳細的使用方法及原理.... 可以上google上去搜尋中央研究院生物醫學科學研究所孫慶姝所寫的一篇 homology modeling 文章中文的....還滿詳細的... 如果找不到的話我在寄給你....就這樣...祝順利... -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 218.162.78.91