[問題] 請問一下有關短序列的blast

看板Biotech (生命科學)作者 (結束)時間19年前 (2006/09/01 14:31), 編輯推噓1(100)
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因為在paper裡面有看到幾個protein(像Eps15,adaptin)都含有一段短的sequence LXXQXTG,我還想要知道還有哪些protein也含有一樣的sequence,但是把這樣一段 序列打進NCBI blast or short/nearly exact match blast都無法找到任何的東西 不知道是因為X太多且序列太短了 還是有其他要注意的 希望知道的大大能夠提供一些意見 非常謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.109.32.9

09/01 19:09, , 1F
試試把word size調小(-w)
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文章代碼(AID): #14zzFOCE (Biotech)
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