Re: [問題] 請問突變transcription factor binding …
※ 引述《manjushaka (彼岸花開...)》之銘言：
: 我想要突變一個transcription factor binding site
: 但我參考其他paper
: 發現同一種transcription factor binding site序列不太一樣
: 而作者有時突變掉兩個nt 有時突變掉3個nt
: 請問有經驗的版友
: 怎麼去決定這一段序列該突變掉其他哪幾個nt才是最重要的呢?
: 希望有人可以為我解惑^^"非常感謝
通常不知道transcription factor exactly結合的位置
我會用scanning mutagenesis EMSA先去看主要binding位置在哪？
重要位置突變的oligonucleotide無法競爭wild type probe形成的shift
反之可以
之後就可看出大約是binding在哪
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