[問題] 如何尋找轉錄因子未知的DNA結合位

看板Biotech (生命科學)作者 (Qb)時間19年前 (2007/06/28 10:26), 編輯推噓2(204)
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請教各位 如果今天我找到ㄧ個轉錄因子 但是不知道他調控的基因是哪一個 我希望能先找到此蛋白結合的promoter 再從database中找它調控的基因 目前我想到的方式是利用ChIP的方法 找到結合的DNA 但一般的ChIP都是利用已知的primer將DNA PCR放大 那結合上此蛋白的未知DNA我要如何將它選殖出來呢? 如果使用random primer是否可行? 亦或是有其它的方法可以得到這段DNA 希望有做過這方面實驗的版友能提供一點資訊 感激不盡...... -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.129.77.130

06/28 12:54, , 1F
Search ChIP-chip
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07/02 15:35, , 2F
先去看看有沒有人發表這個轉錄因子的結構之類的
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然後看看這個轉錄因子有沒有某些motif
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跟其他的轉錄因子一樣......
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去推測以後...可以做Ch-ip...EMSA..footprint...
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甚至是promoter assay
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文章代碼(AID): #16WnmuoN (Biotech)
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