[求救] 設計primer需要用到ESTs的比對嗎??

看板Biotech (生命科學)作者 (在微笑中 我想我可以很好)時間18年前 (2007/10/17 12:02), 編輯推噓10(1000)
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目前我想針對一個蛋白設計出他的primer 那我先找出他的amino acid seq後 需要把他轉成CDS嗎 然後..如果在NCBI上就已經找得到這個蛋白的mRNA seq 我是要用CDS 的還是用原本那個mRNA seq (有點混亂) 然後..ESTs的功用是什麼?? 設計primer需要用到這個database嗎 對不起阿...我真的很混亂.. 希望大家幫個忙.. -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 123.240.136.150

10/17 12:08, , 1F
你設計primer的目的是? 如果要表現全長蛋白質 就看CDS
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10/17 12:09, , 2F
如果要RT-PCR 則mRNA序列合適的地方都可以.
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10/17 12:12, , 3F
NCBI mRNA上的資訊 旁邊就有CDS是從哪裡到哪裡的資訊
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10/17 15:14, , 4F
我是要看這個蛋白的mRNA在那個時期會表現
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10/17 15:23, , 5F
那應該做RT-PCR或是northern就可以了, mRNA上的序列都可用
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10/17 15:23, , 6F
但是不見得要全長 RT-PCR 兩三百到是挺適合
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10/17 15:45, , 7F
那我是不是要避開isoform的地方呢??
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10/17 15:52, , 8F
恩 如果選擇的區域 最好有他的獨特性
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10/17 16:10, , 9F
嗯嗯!!謝謝你阿!!如果有問題可以再麻煩你嗎??
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10/17 16:21, , 10F
貼在板上應該很多大大都可以一起討論喔
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文章代碼(AID): #175ObMdJ (Biotech)
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