[求救] 關於microRNA microarray 和 real-time PCR 的問題

看板Biotech (生命科學)作者 (大頭)時間18年前 (2008/04/18 01:52), 編輯推噓7(707)
留言14則, 7人參與, 最新討論串1/1
我是利用invitrogen 出的 NCode microRNA microarray 來偵測癌細胞和正常細胞內 microRNA表現的差異 再利用ABI 公司的 Taqman real-time PCR 來comfirm 可是real-time PCR的結果 和array 卻是大大的不同 有的甚至是相反的或是表現沒有什麼差異性 我做了八個microRNA 幾乎都是這樣 sample是病人的檢體和老鼠 總共做了十片的array 請教一下各位 有人知道原因是什麼嗎 或是可以給我什麼建議 謝謝~~~~~~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 125.231.210.136

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一樣的sample,我會相信real-time PCR的結果
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array出來的東西誤差很大的
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我們家也是遇到這個問題.. microarray跟PCR R < 0
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後來我們就不管nCode了 array改用別家的
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NCode的數據正規化是問題所在, 沒有可挽救的方法
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找oligo probe的, 會比NCode打點好很多..
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array因normalise條件不同 結果也會不同 qPCR較準+1
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謝謝大家給我的回答 那目前我最好的方法 是不是就是直接
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放棄array的結果了
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http://0rz.tw/103YT TaqMan miRNA assay
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miRNA signature predicts survival and relapse in Lung C
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Cancer Cell. 2008 Jan;13:48-57. Yang PC
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NCode要做normalization真的是個問題 j大能否分享一下心得
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我看過Yang PC先生的那篇PAPER了 聽說 砸了一千多萬做的
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文章代碼(AID): #181uvJQ2 (Biotech)
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