[方法] 請問除了in gel digest以外還有其它的方式嗎?

看板Biotech (生命科學)作者 (飛魚)時間18年前 (2008/06/16 11:44), 編輯推噓3(301)
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想請教一下 我用ingel digest的方式得到peptide之後要去打mass 結果我剛才才發現我的protein sample,為一個大約200個胺基酸長的protein 並不存在Lysine(K)這個胺基酸 而ingel digest 是用trypsin做酵素切割,是必須認R 跟K這兩個胺基酸 如果說我的protein sequence裡頭不存在K的話,是不是就代表用ingel digest 無法進行呀? 如果真是如此的話,還有其它的方式做MS分析嗎@@" 之前完全沒碰過蛋白質鑑定,跟別人要了實驗步驟就做下去了..沒查清楚> <" 麻煩大家給個建議 謝謝! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 192.192.90.35

06/16 13:42, , 1F
可以找其他能用的酵素來切,不一定要用trypsin
06/16 13:42, 1F

06/16 14:22, , 2F
pepsin不也可以?!只是打msaa時要註明~
06/16 14:22, 2F

06/17 20:49, , 3F
不是還有R嗎? 最好切位是正電荷胺基酸 Mass比較好打
06/17 20:49, 3F

06/17 20:50, , 4F
R and K ,有其中一個即可
06/17 20:50, 4F
文章代碼(AID): #18LU66EL (Biotech)
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