[討論] 定序之band的位置

看板Biotech (生命科學)作者 (或許天堂也常日落)時間17年前 (2008/07/14 09:49), 編輯推噓7(706)
留言13則, 7人參與, 最新討論串1/1
話說在前面~我是做植物實驗的! 那天我在試定序實驗時發現,同一個primer 但不同物種的定序,出來的band位置有 些微的差距(約1-200bp)...... 所以有沒有可能不同物種有band位置不同的差異呢?還是我其中一個物種的條件設 錯了呢? 不好意思,我在定序方面是個新手~請大家指教~謝謝! -- 遺憾提醒我們曾經幸福的可能 但 我們畢竟是錯過了! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 211.75.55.226

07/14 12:22, , 1F
定序自己定喔?
07/14 12:22, 1F

07/14 13:49, , 2F
不是哦~拿去拿別人定,只是我會先跑膠看位置!
07/14 13:49, 2F

07/14 14:02, , 3F
所以你用primer去做PCR?
07/14 14:02, 3F

07/14 14:48, , 4F
樓上應該是正解......
07/14 14:48, 4F

07/14 14:49, , 5F
如果是這樣的話 不同物種片段有大小差異是很正常的
07/14 14:49, 5F

07/14 15:01, , 6F
我的意思是由照片上看起來位置不太一樣
07/14 15:01, 6F

07/14 15:02, , 7F
不是由定序公司解出來長度的差異哦~
07/14 15:02, 7F

07/14 19:06, , 8F
照片上位置不同? 定序回來的長度卻相同? 不是這樣吧?
07/14 19:06, 8F

07/14 20:55, , 9F
有可能阿!PCR product片段 剛好在不同物種有差異的區域
07/14 20:55, 9F

07/14 20:56, , 10F
但是要跟你的定序結果比對看看 合不合
07/14 20:56, 10F

07/14 21:38, , 11F
把序列上NCBI比對,可以和已發表物種的序列比較identity
07/14 21:38, 11F

07/14 21:39, , 12F
也可以知道不同物種之間相同基因的差異...
07/14 21:39, 12F

07/15 10:42, , 13F
不同物種的同源基因還是會有不同,所以是正常的
07/15 10:42, 13F
文章代碼(AID): #18Uh2hBX (Biotech)
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