[求救] Q-PCR

看板Biotech (生命科學)作者 (酸糖果)時間17年前 (2008/12/21 01:01), 編輯推噓1(102)
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最近在做Q-PCR碰到一些問題,請大家幫忙,謝謝 問題一: 我把磨好的RNA轉成cDNA後 先用一般PCR拿actin當primer 來先確認我的RNA有沒有問題 結果:只有single band 又我的sample是有轉基因跟沒有轉基因的植物 所以我又拿我轉基因的primer去pcr 確定沒有轉基因沒有band,而有轉基因的植物有band 並且都是single band 所以接下來我就直接拿這些sample當template 來進行Q-PCR 看結果是有螢光被偵測到(有被放大) 但是NTC和sample被放大的倍數是一樣的 然後melting curve非常專一(包括NTC都有起來) 然後跑膠之後 NTC是空的 但sample的部份全都smear 請問 這是怎麼一回事? 是不是我的sample有DNA污染? 還是......? 問題二: 我設計一組A gene的primer,預期要p到的大小為200bp 所以我先用一般的pcr進行測試 但不論怎麼p,提高溫度還是什麼的 p到的長度都是450bp左右,並且是single band 但一樣的產物,換另一組B gene當primer進行PCR 得到的結果和預期的大小是一樣的 再換另一組不同的C gene,也和預期大小一樣 請問,A gene那組的primer發生什麼問題? 還是那裡出了問題? 麻煩線上的高手們幫忙解答 這實驗卡了也一陣子了 我想快畢業走人 就剩這個實驗了 請大家幫忙,謝謝 -- -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 122.118.34.157

12/21 01:02, , 1F
忘了說,我是用SYBR GREEN
12/21 01:02, 1F

12/22 09:37, , 2F
有做negative控制組嗎 就是只用RNA做PCR 看有無DNA殘留哩
12/22 09:37, 2F

12/24 11:56, , 3F
有做negative control都沒問題
12/24 11:56, 3F
文章代碼(AID): #19JIJL7w (Biotech)
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