[求救] SDS-PAGE鑄膠問題

看板Biotech (生命科學)作者 (專注)時間17年前 (2009/05/03 20:38), 編輯推噓6(605)
留言11則, 7人參與, 7年前最新討論串1/1
大家好 最近在做SDS-PAGE的膠片時 running gel 的最兩邊在凝膠之後會出現氣泡 就是在最左邊和最右邊的well範圍會有那種不規則的氣泡 有點像變形蟲的觸手那樣 因為之前在做的時候都不會有這樣的情形 但最近卻常遇到 問過實驗室的學長姐大家不是沒有這種情形就是偶爾很久會一次 但也不知道原因為何? 目前我想得到的變因 就只有一個 就是最近多了兩個之前都沒有在跑SDS-PAGE的人來使用 但我也想不出會是個人習慣的哪個部分出了問題? 或者是我自己哪邊有和以前不一樣 是自己的疏失 所以想來請教各位前輩 過去有無類似的經驗? 該如何解決? 謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.74.19

05/03 20:50, , 1F
check buffer concentration and pH
05/03 20:50, 1F
這個我確定沒問題耶

05/04 05:08, , 2F
comb兩邊的小觸手斷掉了?
05/04 05:08, 2F
好像有喔...請問小觸手的作用是...? -- 我想補充一下 因為這幾次有類似的情形發生 所以我在鑄膠的時候都有注意要把他混均勻 混的時候也只是輕輕的上下pipette一下 沒有讓氣泡產生在我配的溶液內 loading膠到玻璃的時候也有注意有無氣泡產生 用isopropanol壓平之後我還特別檢查確定沒有氣泡 但是在膠凝了之後卻有變形蟲形狀的氣泡產生 = = 真得是很詭異...... 會不會是reagent哪裡有問題呢? -- 然後我還有另一個問題 = = 在我純化完之後 跑完SDS-PAGE 發現每個well都有一條約 60 kD 的band 而且竟然連空的well(只有loading dye)都有!!! 但我問過最近有跑的人 他們的膠片上都沒有 所以初步排除 dye 遭到汙染的可能 有時候那條 band 甚至會和其他well內的 band 手牽手 想請問大家會是什麼原因啊? 拜託了~感謝 ※ 編輯: littlelizard 來自: 140.112.74.19 (05/04 11:59)

05/04 13:02, , 3F
變形蟲氣泡應該是接觸到空氣 兩邊沒有夾緊?
05/04 13:02, 3F

05/04 13:08, , 4F
我有次忘記加isopropanol在上方有看過 但在兩邊沒有遇過@_@
05/04 13:08, 4F

05/04 22:06, , 5F
那你的是biorad的嗎~若是的話~comb最兩邊把手斷掉造成的
05/04 22:06, 5F

05/04 22:39, , 6F
是Biorad沒錯 不過小把手的作用到底是...?
05/04 22:39, 6F

05/04 22:40, , 7F
另外 我跑15% 目前發現學妹的15%也會這樣 其他%不會
05/04 22:40, 7F

05/05 00:57, , 8F
BioRad 的小把手應該是隔離空氣用的 但是我覺得超容易斷
05/05 00:57, 8F

05/05 11:40, , 9F
膠接觸空氣不易凝膠。comb斷了可以塞牙籤幫助阻絕空氣
05/05 11:40, 9F
原本我以為是因為我用15%膠的問題 我今天發現那個氣泡是在膠和玻璃之間 用力擠壓玻璃之後就可以把泡泡排掉 所以泡泡的問題暫時算是解決了 目前只剩下well內會有奇怪的band 初步判斷是background 因為15%膠比較退不乾淨 退太久目標片段就不見了...囧 但今天跑了純化濃縮後的發現 這東西確實存在我sample裡 還需要進一步釐清 大概是這樣 感謝各位寶貴的意見^^ ※ 編輯: littlelizard 來自: 140.112.74.19 (05/05 19:34)

05/06 16:19, , 10F
每個well都會出現的話,可能是拔comb時造成stacking和runin
05/06 16:19, 10F

05/06 16:20, , 11F
產成分離的現象,尤其runing的濃度越高越容易出現。
05/06 16:20, 11F
是喔...那請問有解決方法嗎? 之前我使用的是29:1孔徑的acrylamide 最近實驗室買了37:1的 學姐有建議我換這個試試看 另外學姐也建議我可以try一下peptide gel 感覺要 Trouble shooting 還真不容易耶 = = ※ 編輯: littlelizard 來自: 61.224.24.196 (05/07 00:56)

11/11 01:27, , 12F
BioRad 的小把手 https://muxiv.com
11/11 01:27, 12F

01/03 16:54, 7年前 , 13F
是Biorad沒錯 不 https://noxiv.com
01/03 16:54, 13F
文章代碼(AID): #19_P0h6- (Biotech)
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