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[求救] PCR primer with RE cutting site Tm

看板Biotech (生命科學)作者 (洛)時間16年前 (2009/08/13 12:18), 編輯推噓4(4推 0噓 5→)
留言9則, 6人參與, 最新討論串1/1
想請問當primer 5'端加入限制脢切位序列時， primer 的 Tm 值計算會包含限制脢切位的序列嗎? 這個問題一直找不到答案@ @ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.116.61.117
推
08/13 12:42, , 1F
會
08/13 12:42, 1F
推
08/14 00:09, , 2F
不會算吧@@ 額外的base或是不是序列上的不是不算嗎?!
08/14 00:09, 2F
推
08/14 11:22, , 3F
跟template binding的序列才會算 外加限制酶切位不會算
08/14 11:22, 3F
推
08/14 13:50, , 4F
可以在後面cycle再算進去
08/14 13:50, 4F
→
08/14 22:07, , 5F
你設計的時候當然不會把RE site的 Tm 一起算進去
08/14 22:07, 5F
→
08/14 22:08, , 6F
可是合成primer的廠商不會管你那麼多 你給他多少序列
08/14 22:08, 6F
→
08/14 22:09, , 7F
廠商就計算多長的Tm值,所以你可以找軟體幫你算 主要區段的
08/14 22:09, 7F
→
08/14 22:10, , 8F
Tm值就好了
08/14 22:10, 8F
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08/15 09:10, , 9F
了解~~感謝回覆~~!!
08/15 09:10, 9F
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