[問題]關於PRIMER設計和BLAST的問題

看板Biotech (生命科學)作者 (新的鄉民XD)時間16年前 (2009/08/26 18:11), 編輯推噓0(002)
留言2則, 2人參與, 最新討論串1/1
不好意思想請問各位我步驟上哪邊有問題 因為今天設計的PRIMER去BLAST都是很多HIT啊XD 首先 找特定GENE~選其CDS序列丟入pick primer 選好product size後~tm值分別是 min 53 opt 56 max 59 DATABASE選第一個~然後pick pick出來的再丟到blast比對 一次丟一條forward或reverse(也就是分開丟) database選human g+t program選megablast 然後就讓他跑~ 但每次出來都是好幾百條hit啊@@" 是我哪邊勾選錯誤嗎? blast時f和r一起放我也試過了 但不太清楚是哪邊的問題 麻煩各位了!謝謝! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.121.97

08/26 18:14, , 1F
忘了說~GC比是40~60%
08/26 18:14, 1F

08/26 19:41, , 2F
NCBI的BLAST TOOL嗎? 那BLAST有PRIMER BLAST可以選喔
08/26 19:41, 2F
文章代碼(AID): #1AbGfNsu (Biotech)
文章代碼(AID): #1AbGfNsu (Biotech)