[求救] 抽RNA會降解

看板Biotech (生命科學)作者 (invection )時間16年前 (2009/10/31 13:10), 編輯推噓1(108)
留言9則, 4人參與, 最新討論串1/1
我是抽取關節液離心下來的細胞RNA.裡面應該是白血球之類的細胞.不過很像沒有像一般 細胞這麼純.總之大約一個eppendorf中有大約120mg的細胞. 他們現在都是放在-80度.並沒有加trizol. 但我要抽取RNA好像都會degrade. 我是將sample從-80度c冰箱拿出後就直接放冰上.然後加入從4度C冰箱拿出的TRIZOL. 直接加入大約1.2ml TRIZOL.就用20G空針將cell回溶於TRIZOL中.過程中會在冰上進行. 會有一些白白的粘稠物體可以被homogenized.但還是會有一些怎樣都溶不了的部分. PROTOCOL是說這些insoluble可以12000g 離心去除.不過又有人說這些insoluble如果沒有 homogenized的話就會造成RNA degrade? 不過無論有沒有完全homogenized. 我就放室溫5min.不知道這邊是不是那些insoluble造成 RNA degrade? RNA抽出來跑TAE電泳並非是全部smear很嚴重.不過就是十來條bands.看起來像marker那樣. 不過我想這就是degrade了吧?? 所以就沒有再去轉cDNA了..... 想問問各位有經驗的人.我應該要如何handle 從-80度冰箱拿出來的frozen sample呢? 我知道sample有一點點thawed就會RNA degrade.但是不懂的是.加入TRIZOL不可能就自己 homogenized啊.還是需要花上兩三分鐘的時間讓sample慢慢溶化在TRIZOL.然後才能 homogenize. 拜託大家幫幫我啊.....這些sample取得不易啊......感謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 61.230.123.18

10/31 14:28, , 1F
感覺問題是出在之前凍存的步驟沒有做處理
10/31 14:28, 1F

11/01 10:49, , 2F
怎麼不抽出來就加TRIZOL呢? 至少有RNase抑制的效果~
11/01 10:49, 2F

11/01 10:51, , 3F
不然就抽出來就直接做到酒精沉澱再丟-80度C,要用再溶..
11/01 10:51, 3F

11/01 10:52, , 4F
你既然要轉cDNA,sample又很珍貴,ABI有kit是符合需求的..
11/01 10:52, 4F

11/02 00:54, , 5F
建議冷凍前就要加trizol或是其他廠牌的lysis buffer
11/02 00:54, 5F

11/02 00:55, , 6F
直接冷凍一定會degrade 你們的學長姊的protocol難道都是
11/02 00:55, 6F

11/02 00:55, , 7F
直接冷凍??
11/02 00:55, 7F

11/02 18:47, , 8F
那是之前的人留下來的sample.所以沒有辦法挽救了>.<
11/02 18:47, 8F

11/04 04:08, , 9F
那可能要用特殊的kit來抽不能用trizol 很貴
11/04 04:08, 9F
文章代碼(AID): #1AwyRLE0 (Biotech)
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