[求救] 請問有關5'-UTR的問題
大家好
我現在想要測試某蛋白質與另一基因的 mRNA 5'-UTR 之間是否有interaction
我的想法是，先設計一對primers，從細胞DNA中將5'-UTR對應的cDNA釣出來，
再用 in vitro transcription 把她轉成 RNA，之後再將此RNA產物與純化蛋白
incubate之後，進行 gel shift assay.
不知以上流程有沒有什麼問題?
如果這方法可行，我現在遇到了兩個問題:
a. 要怎麼找到一個基因他5'-UTR對應的 DNA seq?
我在NCBI上弄了老半天還是只能得到一整條 chromosome....
b. 我查到了此基因的 mRNA 序列 (NM_....)
在CDS之前的那段是否就是5'UTR?
抱歉，因為不是做這方面的，問的問題有點笨拙請見諒!
也希望有強者能幫幫我~
謝謝!
--
天使 在你 背後那樣模糊 天使 為你 你沒責任動情
天使 是我 你或未曾在乎 天使 是我 背負昨日罪名
能夠為你守護 置自己於不顧
全意為你守護 那是我天賦
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