[方法] 使用Western blot看 protein dimer

看板Biotech (生命科學)作者 (FUJI0904)時間15年前 (2011/04/12 13:19), 編輯推噓0(0011)
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先感謝之前發文時回覆我的各位。 由於老闆要我先安排之後的實驗,設計好要報給她和大家聽 上一篇有說過,我做的是藥物 treat 後看 apoptosis 的關聯與影響 老闆要我先確定該藥物會否走 ROS → mitochondria membrane dysfunction 的路徑 所以在 cell cycle 和 WB 測 caspase 3 活化程度後,如果有好的結果 可能要用染劑 JC-1 和 DCF-DA 測 mitochondria membrane potential 和 ROS 但老闆也說要我看看 Bcl-2 表現與 conformational change 和 Bax 的 "dimerization" 我知道 Bax 的 "dimerization" 應該可以用 gel filtration 來看 但老闆說她看過有 paper 說做粒線體分離再用 WB 看就好,似乎她也沒有很想買 kit,叫 我查看看 我是有查到的確有paper這樣做,粒線體分離出來後用不含 2-Me 和 DTT 的buffer lysis 並跑 nonreducing gel,我的感覺是為了避免打斷 Bax dimer 間的雙硫鍵 但 paper 又說: Cell lysis and the denaturing electrophoretic run were performed in nonreducing conditions (i.e., DTT and β-mercaptoethanol were omitted, respectively) to preserve eventual disulfides. 這樣的意思到底是要不要加熱作 denature 呢? 如要,加熱就不會打斷雙硫鍵破壞 dimer 嗎? 懇請能人前被指教,感激不盡 <(_ _)> -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.117.39.44

04/12 14:59, , 1F
non-reducing也是要加熱讓反應完全些,只是不含DTT or 2ME
04/12 14:59, 1F

04/12 23:15, , 2F
我最近也在跑non-reducing gel,使用不含DTT或2ME的loading dye
04/12 23:15, 2F

04/12 23:16, , 3F
sample不加熱,gel配置沒有改變,可偵測到dimer
04/12 23:16, 3F

04/12 23:19, , 4F
抱歉~是non-reducing condition不是non-reducing gel...
04/12 23:19, 4F

04/12 23:30, , 5F
那請問在抽蛋白時,有些buffer會含 1~2 mM 的 DTT (可能
04/12 23:30, 5F

04/12 23:31, , 6F
是當作保護吧...這部份的DTT也不要加嗎? 還是其實影響
04/12 23:31, 6F

04/12 23:32, , 7F
不大呢? 感謝j大
04/12 23:32, 7F

04/12 23:48, , 8F
http://ppt.cc/lSiX 不曉得影響大不大,理論上要保持雙硫鍵就
04/12 23:48, 8F

04/12 23:49, , 9F
避免使用DTT,但有時候理論跟實際也不一定相符XD 試了就知道
04/12 23:49, 9F

04/13 00:17, , 10F
所以j大抽蛋白時有添加 DTT 或 B-Me 嗎?
04/13 00:17, 10F

04/14 01:20, , 11F
沒有添加DTT or B-Me
04/14 01:20, 11F
文章代碼(AID): #1De-3DkO (Biotech)
文章代碼(AID): #1De-3DkO (Biotech)