[求救] HUVEC抽RNA

看板Biotech (生命科學)作者 (深海大鯊魚)時間14年前 (2011/12/11 23:39), 編輯推噓1(109)
留言10則, 3人參與, 最新討論串1/1
各位版友好 每次做HUVEC時都看不到沉澱,這樣算正常嗎?我是6well(2.5X10^5養一天) 然後這次抽RNA時覺得怪怪的,定量時RNA濃度不夠 希望專家可以幫我解惑,或步驟可以改善的,謝謝^___^ 下面是抽RNA的步驟 (抽RNA) 1.加Tri reagent 500 uL 2.用刮勺刮下細胞 3.收至eppendorff,室溫靜置5 min 4.加chloroform 100 uL,vortex vigorously 25-30s, 4度C靜置5 min 5.離心: 12000g, 4度C, 15 min 6.吸上清液220 uL至新eppendorff 7.加Isopropanol 220 uL, vortex mildly 25-30s, 4度C靜置5 min 8.離心: 12000g, 4度C, 10 min 9.倒掉上清液,加500 uL 75% EtOH, 輕微搖eppendorff數次 10.離心: 7500g, 4度C, 5 min 11.重複9, 10步驟一次 12.移至hood airdry 15-20 min 13.加DEPC-H2O 5 uL回溶 14.定量RNA濃度 想請問一下是不是第十步離心轉速的問題(要調至12000g?) 去網路找protocol和自己實驗室的步驟有一些差別 之前做HUVEC的學長畢業了 想問一下大家的看法,感激不盡 -- -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 61.220.23.42

12/12 14:15, , 1F
請問樣本量、比值、濃度、膠圖?
12/12 14:15, 1F

12/12 14:15, , 2F
第十步應該可以調至最高轉速
12/12 14:15, 2F

12/12 14:16, , 3F
確定有完全溶出嗎?
12/12 14:16, 3F
huuban大你好 Sample量以5 uL回溶最多在500 ng/uL左右(之前測的) 細胞量大概是在八九分滿就會開始做了(Starve 8小時) 因為之前做都看不到沉澱,我會在定量RNA時用tip來回攪拌,讓它均勻(輕微,沒有排空氣) 所以轉速應該不會影響到RNA sample吧(之前很納悶為什麼看到的protocol都是7500g的) 如果不影響的話 那小弟就先試試看了 謝謝你Orz ※ 編輯: bigtuna 來自: 120.126.85.122 (12/12 22:42)

12/13 13:49, , 4F
這個嘛,我沒有抽過細胞,你給的條件不好找出問題在哪裡
12/13 13:49, 4F

12/13 13:51, , 5F
在酒精沉澱如果轉速低有可能RNA沒有全部下來吧
12/13 13:51, 5F

12/13 13:51, , 6F
不過假使你每次操作方式都一樣,那這次問題不是出在這裡
12/13 13:51, 6F

12/13 13:53, , 7F
也可能是input量就少所以抽出來就少?
12/13 13:53, 7F

12/14 02:02, , 8F
恩恩 謝謝你 我知道該怎麼做了^^
12/14 02:02, 8F

12/15 09:36, , 9F
第7步可加glycogen然後放-20度C半小時以上幫助沉澱
12/15 09:36, 9F

12/17 23:08, , 10F
謝謝^^
12/17 23:08, 10F
文章代碼(AID): #1EvCwwup (Biotech)
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